Algunas consideraciones generales de identificación bacteriana

Especies S. pyogenes S. agalactiae S. dysgalactiae ssp equisimilis S. equi ssp zooepidemicu s S. grupo anginosus

Grupo A B C,G

PYR + -

C

-

A,C,G

-

S. canis2

G

-

S. porcinus2

E,P,U,V +3

S. iniae2

1Pueden

+

VP -

+

CAMP + -

-

+1

Tre NA NA +

Sor -

Comentarios humanos humanos humanos.

-

+

Animales Ocasional humanos.

-

+

Humanos Colonias pequeñas. animales Ocasional humanos. animales Ocasional humanos. animales Ocasional humanos.

ocurrir excepciones. 2Muy raramente aislados de infecciones en humanos. 3algunas cepas pueden dar reacción débil

ESPECIE NOVO Especies más frecuentes Grupo S. epidermidis S Grupo S. haemolyticus S Grupo S. saprophyticus R S. lugdunensis S Grupo S. warneri S S S. schleiferi ssp schleiferi Especies menos frecuentes S. simulans S S. capitis ssp capitis S S. cohnii ssp cohnii R Grupo S. cohnii R

UREA

MANOSA PYR

ODC

+ + D + -

+ + +

+ + d +

d + -

+ +

d + d +

+ d

-

Esquema propuesto por De Paulis y Col. JCM

Ferm. de Glucosa (Agar TSI) Acido/Acido ó Alcalino/Acido Enterobacteriaceae Vibrionaceae Pasteurellaceae Pruebas importantes: Oxidasa Movilidad Morfología en coloración de Gram Exigencia nutricional

Sin cambio (Alcalino/Neutro) Bacilos Gram negativos no fermentadores de glucosa

Bacterias en coloración de Gram

Ausencia de desarrollo en atmósfera aerobia

Desarrollo en bolsa con generador de anaerobiosis

Aislamiento en aero y anaerobiosis

Ausencia de desarrollo en aero y desarrollo en anaerobiosis Pruebas importantes: Coloración de Gram Identificación: pruebas bioquímicas o galerías de identificación.

Infección de sitio quirúrgico Osteoarticular Asociadas a prótesis

Clínica: presencia de secreción purulenta en el sitio de incisión. Según CDC (1992) se basa en el hallazgo de uno de los siguientes puntos:









Drenaje purulento desde el sitio de incisión o desde un drenaje. Cultivo positivo de una muestra de herida cerrada. Diagnóstico de ISQ hecho por el cirujano. Requerimiento de re-operación. Dehiscencia de la herida. Diagnóstico histológico o por imágenes.

Qué necesitamos conocer para predecir el o los microorganismos implicados?








Cirugía realizada • Cardíaca • Abdominal • Oraofaríngea, etc. Fuentes de Infección. • Endógena: Flora residente de la piel. • Exógena: Personal, instrumental, medio ambiente Vias de infección. • Adquiridas en quirófano. • Adquiridas en sala de internación. • Hematógena o linfática.

Importante: conocer los microorganismos que forman parte de la microbiota habitual y colonizaciones transitorias

Microbiota de piel • • •

ECN / S. aureus / estreptococos Corynebacterium spp Propionibacterium spp

Microbiota gastrointestinal y urogenital • Enterobacterias • Enterococos / estreptocosos • Bacterias anaerobias

Microbiota orofaríngea • Streptococcus grupo viridans • Otros estreptococos • Bacterias anaerobias

Colonización transitoria • Microorganismos que forman parte del ambiente hospitalario

Importante: conocer los microorganismos que pueden adquirirse en forma exógena

Personal

Instrumental / Medio ambiente • Clostridium perfringens

•

ECN

•

S. aureus

• Hongos ambientales

•

Enterococos

• Micobacterias de rápido

crecimiento • Microorganismos que sobreviven en medios inertes: EVR / Kpn / Aba

Transmisión cruzada • P. aeruginosa • Enterobacterias multirresistente (BLEE / KPC) • Acinetobacter spp • EVR

Procedimiento

Microorganismos

Cirugía cardiovascular Neurocirugía Osteoarticular

S. aureus, S. epidermidis, P. acnes.

Cirugía de cabeza y cuello

S. aureus, Streptococcus viridans, Fusobacterium, Bacteroides, Actinomyces

Cirugía abdominal / urogenital

BGN, enterococos, Clostridium,

Bacteroides

CIRUGÍA

MUESTRA

Cardiovascular

Punción esternal sup, p. subxifoidea, muestras mediastinales intraquirúrgicaas (liq. mediastinal, pericárdico, pleural, tejido mediastinal, pleural, etc.)

Abdominal

Punción abdominal percutánea guiada por Ecografía o TAC, muestras abdominales intraquirúrgicas.

Ortopédica

Punción ósea o articular guiadas por Ecografía o TAC, muestras osteoarticulares intraquirúrgicas, prótesis ostearticular

Neurocirugía LCR (punción lumbar o reservorio), punción de herida superficial, punta de catéter ventricular. Oftálmica

Lentes intraoculares, humor vítreo y acuoso, muestras intraquirúrgicas.

Ginecológica Muestras obtenidas por laparatomía, punción percutánea, muestras intraquirúrgicas.


Valor de la coloración de Gram Permite evaluar reacción inflamatoria No es útil para evaluar invasión de tejidos Presencia de microorganismos indica una carga bacteriana > 10 6 ufc/ml Un resultado negativo no descarta la presencia de bacterias Ante la observación de un morfotipo bacteriano determinado permite orientar el tratamiento empírico inicial.

Observación diaria de las placas y los medio líquidos.  Cultivo aerobios medios sólidos se incuban 72 hs, medio líquido 7 días.  Cultivo anaerobios 7 días.  Sospecha de micosis incubar los medios para hongos 4 semanas.  Sospecha de micobacterias: 

 Rápido

crecimiento: 5-7 días  Complejo tuberculosis: 8 semanas

Evaluar los cultivos en el contexto de:  Exámen directo.  Crecimiento en caldo o en medio sólido directo.  Tipo de microorganismo aislado.  Cirugía cardiovascular, oftálmica, ortopédica o neuroquirúrgica, la mayoría de los cultivos son monomicrobianos (considerar respuesta inflamatoria y presencia de gérmenes).  Cirugía abdominal y ginecológica son frecuentemente polimicrobianas. Es importante el aislamiento de microorganismos no esperados o con mecanismos de resistencia especiales

Osteomielits Artritis séptica Infecciones asociadas a implantes

Diagnóstico: Examen clínico Diagnostico por Imágenes Diagnostico anatomopatológico Diagnóstico microbiologíco

Utilidad Diagnóstico microbiológico: permite conocer el agente etiológico y su perfil de sensibilidad e instaurar un tratamiento antibiótico adecuado.

INOCULACION DIRECTA (microorganismos de piel o del objeto punzante).   

Presencia de cuerpos extraños. Fractura expuesta. Maniobras invasivas. Punción lumbar. • Punción suprapúbica. •



Post- quirúrgicas con o sin prótesis. Clavos. • Placas. • Cuerpos extraños. •

 

Mordedura animal o humana. Punción accidental de piel.

ASOCIADA A FOCO CONTIGUO. El microorganismo se inocula desde un foco infecciosos adyacente  Enfermedad vascular  Diabetes – ulceras HEMATOGENA DE LOS NIÑOS  Afecta huesos largos

BACILOS GRAM NEGATIVOS ALCOHOLISMO, DIABETES, ENFERMEDAD MALIGNA, HEMOGLOBINOPATIAS, HERIDAS PENETRANTES, DROGADICCION ENDOVENOSA, POSTQUIRURGICAS INTRAHOSPITALARIAS, COLAGENOPATIAS.

ESTAFILOCOCOS COAGULASA NEGATIVOS POSTCIRUGIA CARDIOTORACICA, SECUNDARIA A INFECCION DE PROTESIS OSTEOARTICULAR, SECUNDARIA A INFECCION DE SHUNT.

ESTREPTOCOCOS VIRIDANS Y ENTEROCOCOS MORDEDURA, PIE DIABETICO, ULCERA POR DECUBITO.

ANAEROBIOS FRACTURAS EXPUESTAS, OTITIS O SINUSITIS MEDIAS CRONICAS, MORDEDURAS, SECUNDARIA A FOCO ABDOMINAL, ULCERAS POR DECUBITO, PIE DIABETICO, PROTESIS INFECTADAS.




IMÁGENES • • • •




LABORATORIO • •





RX RMN TAC CENTELLOGRAFIA

RECUENTO DE BLANCOS ERITROSEDIMENTACION

HISTOPATOLOGIA MICROBIOLOGIA

Diagnostico microbiológico. Osteomielitis Muestras:

Biopsia osea Hemocultivos perifericos Punción de absceso cerrado

Biopsia osea Cultivo S 87% previo al inicio de tratamiento antibiótico Mas de una muestra aumenta la rentabilidad diagnóstica Hueso, raspados y material necrótico extraído Hemocultivos periféricos positivos en 50% de los casos de osteomielitis aguda. Sumar muestra ósea cuando se aísla un microorganismo que habitualmente no produciría osteomielitis

Muestra por punción de absceso cerrado Evita el arrastre de colonizantes de la piel

Evitar los hisopados de heridas, ulceras y fistulas: arrastre flora habitual de piel VPP del cultivo de hisopado de fistula 50% S. aureus, menor para otros microorganismos