Microdiseño de Microbiología y Parasitología por Competencias Programa de Medicina, Facultad de Ciencias de la Salud Docente: Alexander Salazar Ceballos. Enero 2011. Nombre del curso: Microbiología y Parasitología Créditos: 5 Semestre: V del Programa de Medicina Docentes: Alexander Salazar Ceballos (Docente Tiempo Completo- teoría y laboratorio). Horarios teoría 2010-2: Lunes 10-12 a.m. (Gorgona Bloque 8-211); martes 2-4 p.m. (Gorgona, Bloque 8-213); miércoles 4-6 p.m. (Sierra Nevada sur 203); jueves 2-4 p.m. (Ciénaga grande sur 303). Horarios laboratorio: Lunes grupo 01 de 2-5 p.m. Grupo 02 de 5-8 p.m. Introducción El curso de Microbiología y Parasitología para los futuros profesionales de la medicina está diseñado para acercar al estudiante al maravilloso mundo de la microbiología médica. En esta fase de su formación académica el estudiante aplicará los conocimientos previos de biología celular y molecular, bioquímica, fisiología, e inmunología, así como también de estadística y epidemiología. El curso brindará la comprensión global de cada uno de los cuatro grupos de microorganismos, como son: bacteriología, virología, parasitología, y micología. Se abordará la biología general de los microorganismos, los mecanismos de transmisión, patología, sintomatología clínica, diagnóstico, factores de riesgos, y epidemiología de los microorganismos más relevantes de cada grupo. La presentación de cada uno de los tópicos abajo esquematizados es dinámic a y rica en actividades académicas con el fin de mantener vivo el interés de los estudiantes en el fascinante y complejo mundo de los microorganismos. Estas actividades incluyen: conferencias magistrales tanto por el docente como por los estudiantes, presentación de “case report” y estudios epidemiológicos. Para las exposiciones de los estudiantes se enfatizará en una adecuada selección de los artículos científicos de revistas científicas, principalmente en Inglés y disponibles de forma gratuita en Internet. Los textos de microbiología no incluyen estas “ayudas extras” de adquisición del conocimiento en contexto, por lo tanto se espera que el estudiante aproveche al máximo este curso para la adquisición de habilidades las cuales le serán de gran beneficio en su vida académica y laboral.
¿Por qué se ha diseñado este curso bajo la modalidad de competencias? Porque el estudiante además de recibir el conocimiento de la microbiología médica, también adquirirá habilidades como búsqueda de artículos científicos en Internet, lectura de artículos en lengua inglesa, trabajo en grupo, presentación de trabajos ante un público, y aprenderá a integrar los conocimientos adquiridos previamente y los aplicará a la microbiología médica. Competencias genéricas a adquirir por el estudiante durante el curso de Microbiología y Parasitología 1. El estudiante comprenderá que las infecciones por microorganismos causan diferentes grados de severidad de enfermedades, pero que también existen medios de prevención ubicándose estas infecciones como inmunoprevenibles. El estudiante será confrontado entre las infecciones y el Plan Ampliado de Inmunización (PAI). 2. Incrementará sus habilidades en el pensamiento creativo y crítico dado que aplicará los conocimientos previos de la biología celular y molecular, la bioquímica, la inmunología, y la estadística; ya que la microbiología ha evolucionado gracias también al avance en cada una de estas áreas. 3. Tendrá la capacidad de aplicar la teoría a la práctica. Los conocimientos que el estudiante adquiere durante el curso de forma general lo acercarán al mundo de la práctica médica, esto a través de las exposiciones de los artículos científicos. 4. Adquirirá una comprensión sistémica de la microbiología en el contexto colombiano. El estudiante observará que existe un sinnúmero de microorganismos pero que en el contexto colombiano, donde somos un país en vía de desarrollo y del trópico, se presentan infecciones por microorganismos propios de países desarrollados pero también por microorganismos propios de países en vía de desarrollo. 5. Adquirirá habilidades para procesar información de diferentes fuentes tanto impresas como obtenidas por Internet; y de esta manera confrontará los avances de la ciencia con respecto a los conocimientos teóricos impartidos en el aula de clase. Competencias instrumentales a adquirir a partir de la exposición de casos clínicos o artículos epidemiológicos publicados en revistas científicas: 1. Competencias lectoras de artículos científicos en lengua inglesa. 2. Dominio de las nuevas tecnologías de la información y comunicación.
Competencias interpersonales a adquirir del curso 1. Construcción de pensamiento creativo y crítico 2. Desarrollo del aprendizaje autónomo y permanente. 3. Coordinación, liderazgo y trabajo en equipo: simulando el trabajo en un ambiente hospitalario. Evaluación del curso acorde con el reglamento estudiantil:
Teoría Laboratorio Total puntos
Primer seguimiento 100 50 150
Segundo seguimiento 100 50 150
Tercer seguimiento 130 70 200
Total puntos 330 170 500
La evaluación teórica comprenderá cuatro evaluaciones. A continuación se presentan los valores para el primer y segundo seguimiento, para el tercer seguimiento la distribución será porcentual conforme con lo abajo plantaeado: 1. La evaluación teórica del contenido (valor 85 puntos) para cada unidad especificado en el parcelador (ver tablas siguientes). 2. Evaluación de la exposición de artículo científico (valor 15 puntos): caso clínico o epidemiológico (teoría) preferible en lengua inglesa. Esta evaluación se integra en la valoración teórica. Competencia evaluada Manejo del tema (fluídez) Tiempo de presentación adecuada. Incluye puntualidad al inicio de la presentación. Calidad de las ayudas didácticas (adecuada bibliografía, especialmente de las imágenes) Adecuada presentación de los expositores Concepto general del docente. Las presentaciones deberán ser revisadas por el docente
Valor competencia 3 3 3 3 3
La revisión de tema será asignado por el docente. NOTA: Si no asisten al día de la exposición no tendrá lugar a reposición y tendrá 0 puntos (deberá existir causa mayor y justificación).
Teoría por Alexander Salazar Ceballos. Primer seguimiento Bacteriología: Fecha 1er seguimiento: Te ma
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tema
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Historia de la microbiología, Clasificación de los microorganismos Morfología y estructuras bacterianas, Metabolismo bacteriano, Medios de cultivo bacteriano Mecanismo de patogénesis bacteriana
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Feb 7
Interacción hospedero-parásito. Repaso de tipos de vacunas net
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Búsqueda de artículos científicos en Internet
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Búsqueda de artículos científicos en Inter
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Manifestaciones clínicas de las infecciones. Ejemplo exposición caso clínico Clasificación de las bacterias, definición de género y especi, conceptos de patógeno primario y oportunista Cocos gram positivos: Staphylococcus. De interés el S. aureus, principales infecciones forúnculo, impétigo, síndrome de la piel escaldada, choque tóxico e intoxicación alimentaria (por toxinas bacterianas). NCCLS: Comité Nacional de Estándares de Laboratorio Clínico. Cocos gram positivos: Streptococcus. De importancia S. pyogenes y S. pneumoniae. El S. pyogenes es causante principalmente de faringitis, fiebre reumática y glomerulonefritis. El S. pneumoniae causa neumonía, otitis media y meningitis; existe la vacuna polivalente compuesta de polisacárido capsular. Diagnóstico microbiológico por técnicas comerciales y moleculares. Revisión de artículos por los estudiantes Corynebacterium diphteriae y Neisseria
Docente y Expositor/ caso clínico grupo de estudiantes Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C Alexander Salazar C
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meningitidis y N. gonorrhoeae (ITS). Bacilos gram: Enterobacterias. E. coli principal causante de diarreas, infecciones urinarias en niños, y principal causante de infección nosocomial. Shigella causante de diarrea disentérica. Salmonella causante de la fiebre tifoidea. Bacilos gram negativos curvos: V. cholerae. Conocer los biotipos: clásico y el Tor. El V. cholerae 01 y 0139 tienen predisposición de causar epidemias con potencial pandémico. Bacilos gram negativos exigentes: Haemophilus influenzae, Bordetella pertussis Bacterias intra celulares: Chlamydia trachomatis (ITS: infección de transmisión sexual: ITS). ¿Cómo se observan las bacterias al gram?. Clínica: tracoma, conjuntivitis neonatal, neumonía infantil, infección urogenital en el hombre y la mujer, infección linfática (linfogranuloma venéreo). Bacilos gram positivos aerobios: Bacillus anthracis. Y bacilos gram positivos anaerobios formadores de esporas: Clostridium perfringes, C. tetani y C. botulinum. Diagnóstico de las infecciones por anaerobios. Bacterias en espiral: Treponema pallidum (ITS). Sífilis 1ª, 2ª, y 3ª. Dx por pruebas no treponémicas (VDRL) y treponémicas, conocer la sensibilidad de las pruebas. Bácilos ácido alcohol resistentes: Mycobacterium tuberculosis y M. leprae. M. tuberculosis: Transmisión vía aérea. Resurgimiento por la actual pandemia del SIDA. Mecanismo de patogenicidad del TB y el macrófago. Sospecha clínica: paciente con más de 15 días de tos con expectoración. Dx: BAAR y cultivo: Lowenstein Jensen y OgawaKudo. Significado de una prueba de tuberculina positiva: > de 5 mm y > 15 mm. Infecciones intrahospitalarias. Programa ampliado de inmunización: S. pneumoniae, C. tetani, H. influenzae, B. pertussis, C. diphteriae Bacilos gram negativos oportunistas: Pseudomonas, infección nosocomial. Primer seguimiento Marzo 16
Alexander Salazar
Alexander Salazar
Alexander Salazar Alexander Salazar
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Introducción a la parasitología. Conceptos
1.1
Amebas de vida libre: N. fowleri. Acanthamoeba spp. Infección generalmente diagnosticada postmortem. N. fowleri de interés en individuos jóvenes con antecedentes de nado aguas termales y Acanthamoeba spp transmitido por aguas de uso industrial. Entamoeba histolytica. Comprender la dificultad de su diagnóstico microscópico por similitud morfológica con E. dispar (no patogénica), causante del absceso hepático amebiano y de la meningoencefalitis amibiana secundaria. Amebas comensales. Su diagnóstico es sinónimo de malas condiciones higiénicosanitarias por parte del infectado. Flagelados y ciliados intestinales. Giardia lamblia. De importancia en los niños y grupos de hacinamiento, no invasora. Trichomona vaginalis, Balantidium coli. La T. vaginalis es considerada una ITS. Introducción a los apicomplexa
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Cryptosporidium parvum: parásito oportunista en pacientes inmunocomprometidos, no invasor. Toxoplasma gondii: parásito oportunista en pacientes inmunocomprometidos, el riesgo de la infección en mujeres gestantes depende del período de la gestación. Protozoos sanguíneos. Apicomplexa: Plasmodium falciparum, Plasmodium vivax. Parásitos transmitidos por vectores, su prueba de oro de diagnóstico es la gota gruesa, generalmente la clínica es independiente del número de parásitos, conocer la latencia del P. vivax Plasmodium falciparum: malaria cerebral. Comprender el mecanismo de patogenicidad del secuestro de los glóbulos rojos infectados por P. falciparum a nivel de los microcapilares. Kinetoplástidos: Trypanosoma cruzi. Parásito transmitido por vectores Kinetoplástidos: Leishmania spp. Parásitos transmitidos por vectores. Introducción a los helmintos
Alexander Salazar Alexander Salazar
Alexander Salazar. Parásito modelo. Alexander Salazar Alexander Salazar Alexander Salazar Alexander Salazar
Alexander Salazar
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Nemátodos: Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Strongyloides stercoralis, Enterobius vermicularis y uncinarias. De importancia principalmente en los campesinos; E. vermicularis es cosmopolita, y S. stercoralis es de interés en inmunocomprometidos. Céstodos: Taenia saginata, Taenia solium, cisticercosis. Diferenciar teniasis de cisticercosis. Infección más importante es la cisticercosis cerebral Céstodos: Hymenolepis nana, Hymenolepis diminuta, Dipilidium caninum Segundo seguimiento . Filariasis: Wurchereria bancrofti, Loa Loa, Brugi malayi, Onchocerca volvulus
Trabajo independiente estudiantes
Tercer seguimiento Virología y Micología: Tema Fecha
tema
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Introducción a la virología
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Influenza humana, aviar e influenza A (H1N1). Conocer el mecanismo de la formación de nuevas variantes antigénicas. Infecciones respiratorias agudas por Virus Respiratorio Sincitial, Parainfluenza, Virus de la Parotiditis, Rinovirus Rotavirus y Virus de la rabia. Composición de las vacunas. Enfermedades virales exantemáticas: sarampión, varicela, rubéola Familia de los Herpesvirus. Entender la latencia de éstos virus y su relación con los pacientes inmunocomprometidos. Virus del Papiloma Humano. Relación VPH y cáncer de cérvix, diagnóstico temprano de laboratorio, mecanismo de transmisión, tipos de alto y bajo riesgo de VPH que componen la vacuna, y composición de la vacuna. Virus de la hepatitis: hepatitis A, B, C, D, E, F. Interpretar el diagnóstico de detección de
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Docente y Expositor/grupo de estudiantes Alexander Salazar Virus modelos. Por Alexander Salazar
Virus modelo
antígenos y anticuerpos contral el VHB, la probabilidad de carcinoma hepatocelular y la prevención de VHB a través de la vacuna. Comprender la epidemiología del VHB en la Sierra Nevada de Santa Marta. 9 Virus de Inmunodeficiencia Humana – SIDA. Virus modelo. Comprender la diferencia entre VIH y SIDA, Por Alexander su diagnóstico por laboratorio (pruebas Salazar presuntiva y confirmatoria), el por qué de las infecciones oportunistas, y la clasificación del CDC en cuanto a la clínica y el recuento de células LT CD4. 10 Virus transmitidos por vectores: dengue, fiebre amarilla. Conocer los factores biológicos, políticos y sociales de la endemicidad del dengue en Santa Marta. ¿Cuál es el riesgo de un brote epidémico por el virus de la fiebre amarilla en Santa Marta? 11 Meningitis virales: Poliovirus y enterovirus. Importancia de la vacuna contra el virus de la poliomielitis Comprender la importancia del PAI y de las vacunas contra los siguientes virus: influenza humana, sarampión, rubeóla, parotiditis, VPH, Fiebre Amarilla, VHB, Virus de la poliomielitis, rotavirus Tema Fecha tema
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Micosis superficiales y cutáneas: dermatofitosis (Trichosporon, Epidermophyton y Microsporum) Evaluación docente Micosis subcutáneas: Esporotricosis linfocutánea, Cromoblastomicosis, Micetoma eumicótico, Cigomicosis subcutánea, Feohifomicosis subcutánea Micosis sistémicas endémicas: Blastomyces dermatitidis, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis Patógenos fúngicos oportunistas: Cándida, Cryptococcus neoformans, Aspergillus Tercer seguimiento
Docente y Expositor/grupo de estudiantes de caso clínico o epidemiológico Alexander Salazar C
Las micosis constituyen el cuarto grupo de importancia de las infecciones por microorganismos. Comprender que en Colombia las principales infecciones micóticas están dadas por las infecciones por dermatofitos seguido de las infecciones oportunistas principalmente por Cándida. Para las exposiciones la selección de las imágenes se sugiere consultar la página de doctor fungus. Laboratorio Tema 1 2 3 4 4.1 5 5.1 6 7 7.1 8 8.1 8.2
Fecha
Tema Generalidades de microbiología. Manejo del microscopio y normas de bioseguridad Cultivo de microorganismos y antibiograma Observación de microorganismos en fresco y coloreados con gram. Lectura de los cultivos bacterianos. Tinción de Ziehl-Neelsen y lectura de placas lectura de placas Parásitos intestinales. Observación de coprológicos Parásitos intestinales. Observación de placas teñidas Parásitos oportunistas, filarias y Trypanosoma cruzi Plasmodium spp y Leishmania spp. Observación de placas teñidas Plasmodium spp y Leishmania spp. Observación de placas teñidas Lectura y microcultivo para hongos Resultados del microcultivo Lectura de placas
Bibliografía Dos textos guías: 1. Microbiología de las infecciones humanas. Corporación para Investigaciones Biológicas. 2. Microbiology and Immunology (University of South Carolina): Curso de Microbiología en línea basado en Medical Microbiology: Patrick R., Ph.D. Murray, Ken S., Ph.D. Rosenthal, George S., Ph.D. Kobayashi, Michael A. Pfaller. http://pathmicro.med.sc.edu/book/intro-sta.htm (Link general) http://pathmicro.med.sc.edu/Spanish/bact-span.htm (Link en español)
Bibliografía laboratorio: Tratado de Microbiología, Davis-Dulbeco, Editorial Salvat Enfermedades Infecciosas, Corporación para Investigaciones Biológicas, Medellín Biología de los Microorganismos, Brock, 10 edición, Prentice Hall Microbiología, 5th Edición Lansing M. Prescott Links a artículos científicos y bases de datos de libros gratuitos:
Revistas on- line de artículos originales científicos
Clinical Microbiology Reviews Journal of Clinical Microbiology Journal of Virology Journal of Bacteriology Clinical and Vaccine Immunology Scientific Electronic Online Emerging Infectious Diseases (CDC) Morbidity and Mortality Weekly Report Biomed Central FreeBooks4Doctors FreeMedicalJournals
http://cmr.asm.org/ http://jcm.asm.org/ http://jvi.asm.org/ http://jb.asm.org/ http://cvi.asm.org http://www.scielo.org/php/index.php http://www.cdc.gov/ncidod/eid/ http://www.cdc.gov/mmwr/ http://www.biomedcentral.com http://www.freebooks4doctors.com http://www.freemedicaljournals.com
Casos clínicos presentados durante el curso: Meningitis aguda por Streptococcus pyogenes: caso clínico y revisión de literatura. Rev Chil Infect (2000); 17(2): 135-138. http://www.scielo.cl/pdf/rci/v17n2/art08.pdf Tuberculosis y SIDA. A propósito de dos casos. Rev Cub Med 2003; 42 (2): http://bvs.sld.cu/revistas/med/vol42_2_03/med09203.pdf Tema Leishmania, tripanosomiasis y hepatitis. Prevalencia de patologías tropicales y factores de riesgo en la comunidad indígena de Bunkwimake, Sierra Nevada de Santa Marta. Duazary, 1er semestre de 2006, Vol 3 No 1. Guía práctica clínica para toxoplasmosis durante el embarazo y toxoplasmosis congénita en Colombia. Infectio 2007; 11 (3): 129-141. Streptococcus suis meningitis, United States. Emerging infectious diseases. www.cdc.gov/eid. vol 14, No 1, January 2008. P. 183-185. A case of neurosyphilis presenting with treatment-resistant psychotic symptoms and progressive cognitive dysfunction. Case report. The German Journal of Psychiatry. http://www. Gipsy.uni-goettingen.de . 2008. Enterotoxigenic Escherichia coli and Vibrio cholerae diarrhea, Bangladesh, 2004. Emerging infectious diseases. www.cdc.gov/eid . vol 11, No 7, July 2005. P. 11041107. Neonatal respiratory tract involvement by Trichomonas vaginalis: a case report and review of the literature. Am.J. Trop. Med. Hyg. 78 (1), 2008, p. 17-19. Nosocomial malaria and saline flush. Emerging infectious diseases. www.cdc.gov/eid . vol 11, No 7, July 2005. P. 1097-1099. Plasmodium falciparum malaria in splecnotomized patients: two case reports in French Guiana and a literature review. Am. J. Trop. Med. Hyg. 71 (3), 2004. P. 290-293.
